Nie znam żadnej innej możliwości ustawiania stosu na stronie w CSS niż z-index.

Trzeba tylko pamiętać, że aby z-index danego elementu zadziałał, element nadrzędny musi mieć również zdefiniowaną wartość z-index (zwłaszcza dla pozycjonowania relatywnego). Czasami zapominamy o tym i stos obiektów nam się trochę "rozłazi".