Można instalować na maszynie fizycznej i wirtualnej.

W przypadku instalacji na maszynie fizycznej warto zagwarantować ha dla SCVMM instalując go na klastrze.

W przypadku instalacji na maszynie wirtualnej warto wykluczyć maszynę z SCVMM z automatycznej migracji (nie powinien przenosić sam siebie).

W odróżnieniu od Vcenter dla ESX, klastrowanie Hyper-V jest na poziomie OS, więc jeśli SCVMM jako maszyna wirtualna stanie się niedostępny, to z klastrem nic się nie dzieje.